Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3aO70157 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3aO70157 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Top3aO70157 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3aO70157 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3aO70157 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3aO70157 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Top3aO70157 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3aO70157 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3aO70157 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3aO70157 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3aO70157 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top3aO70157 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top3aO70157 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top3aO70157 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top3aO70157 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top3aO70157 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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