Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtogO55225 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtogO55225 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
OtogO55225 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtogO55225 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtogO55225 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtogO55225 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
OtogO55225 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtogO55225 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtogO55225 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtogO55225 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
OtogO55225 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtogO55225 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtogO55225 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OtogO55225 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtogO55225 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtogO55225 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtogO55225 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtogO55225 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtogO55225 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtogO55225 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OtogO55225 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OtogO55225 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OtogO55225 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OtogO55225 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OtogO55225 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtogO55225 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtogO55225 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtogO55225 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtogO55225 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtogO55225 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OtogO55225 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtogO55225 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtogO55225 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtogO55225 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtogO55225 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtogO55225 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtogO55225 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtogO55225 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtogO55225 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OtogO55225 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OtogO55225 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtogO55225 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtogO55225 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtogO55225 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtogO55225 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtogO55225 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtogO55225 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
OtogO55225 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtogO55225 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
OtogO55225 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtogO55225 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtogO55225 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtogO55225 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtogO55225 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtogO55225 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtogO55225 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
OtogO55225 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
OtogO55225 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
OtogO55225 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtogO55225 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtogO55225 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtogO55225 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtogO55225 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OtogO55225 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtogO55225 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtogO55225 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtogO55225 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtogO55225 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtogO55225 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtogO55225 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtogO55225 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtogO55225 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OtogO55225 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtogO55225 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtogO55225 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtogO55225 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtogO55225 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtogO55225 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtogO55225 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtogO55225 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtogO55225 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtogO55225 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtogO55225 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtogO55225 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtogO55225 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtogO55225 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OtogO55225 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtogO55225 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms