Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2a2O55143 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2a2O55143 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2a2O55143 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms