Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl35aO55142 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl35aO55142 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms