Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PrxO55103 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrxO55103 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrxO55103 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrxO55103 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrxO55103 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrxO55103 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrxO55103 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrxO55103 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PrxO55103 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PrxO55103 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PrxO55103 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PrxO55103 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PrxO55103 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PrxO55103 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PrxO55103 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PrxO55103 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PrxO55103 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PrxO55103 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PrxO55103 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PrxO55103 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PrxO55103 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PrxO55103 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PrxO55103 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PrxO55103 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PrxO55103 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PrxO55103 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PrxO55103 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PrxO55103 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PrxO55103 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PrxO55103 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PrxO55103 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PrxO55103 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PrxO55103 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PrxO55103 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PrxO55103 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PrxO55103 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PrxO55103 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PrxO55103 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrxO55103 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrxO55103 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrxO55103 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrxO55103 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrxO55103 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrxO55103 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrxO55103 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrxO55103 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PrxO55103 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PrxO55103 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PrxO55103 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PrxO55103 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PrxO55103 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PrxO55103 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PrxO55103 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PrxO55103 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PrxO55103 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PrxO55103 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PrxO55103 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PrxO55103 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PrxO55103 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PrxO55103 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PrxO55103 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PrxO55103 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PrxO55103 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PrxO55103 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrxO55103 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrxO55103 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrxO55103 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrxO55103 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrxO55103 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrxO55103 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrxO55103 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrxO55103 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PrxO55103 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PrxO55103 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PrxO55103 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PrxO55103 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PrxO55103 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PrxO55103 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PrxO55103 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PrxO55103 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PrxO55103 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PrxO55103 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PrxO55103 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PrxO55103 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PrxO55103 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PrxO55103 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PrxO55103 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PrxO55103 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PrxO55103 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PrxO55103 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PrxO55103 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PrxO55103 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PrxO55103 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PrxO55103 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PrxO55103 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PrxO55103 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PrxO55103 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PrxO55103 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PrxO55103 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms