Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnk2O54967 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnk2O54967 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnk2O54967 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnk2O54967 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnk2O54967 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms