Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pole2O54956 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole2O54956 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pole2O54956 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole2O54956 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole2O54956 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pole2O54956 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pole2O54956 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole2O54956 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pole2O54956 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole2O54956 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole2O54956 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole2O54956 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms