Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NlkO54949 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NlkO54949 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NlkO54949 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NlkO54949 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NlkO54949 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NlkO54949 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NlkO54949 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NlkO54949 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NlkO54949 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NlkO54949 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NlkO54949 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NlkO54949 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NlkO54949 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NlkO54949 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NlkO54949 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NlkO54949 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NlkO54949 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NlkO54949 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NlkO54949 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NlkO54949 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NlkO54949 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NlkO54949 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NlkO54949 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NlkO54949 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NlkO54949 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NlkO54949 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NlkO54949 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NlkO54949 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NlkO54949 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NlkO54949 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NlkO54949 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NlkO54949 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NlkO54949 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NlkO54949 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NlkO54949 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NlkO54949 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NlkO54949 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NlkO54949 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NlkO54949 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NlkO54949 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NlkO54949 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NlkO54949 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NlkO54949 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NlkO54949 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NlkO54949 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NlkO54949 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NlkO54949 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NlkO54949 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NlkO54949 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NlkO54949 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NlkO54949 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NlkO54949 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NlkO54949 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NlkO54949 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NlkO54949 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NlkO54949 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NlkO54949 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NlkO54949 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NlkO54949 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NlkO54949 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NlkO54949 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NlkO54949 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NlkO54949 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NlkO54949 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NlkO54949 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NlkO54949 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NlkO54949 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NlkO54949 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NlkO54949 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NlkO54949 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NlkO54949 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NlkO54949 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NlkO54949 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NlkO54949 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NlkO54949 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NlkO54949 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NlkO54949 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NlkO54949 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms