Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb3O54890 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb3O54890 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb3O54890 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms