Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EdaO54693 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EdaO54693 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EdaO54693 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EdaO54693 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EdaO54693 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EdaO54693 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EdaO54693 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EdaO54693 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdaO54693 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EdaO54693 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdaO54693 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EdaO54693 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdaO54693 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdaO54693 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdaO54693 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdaO54693 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdaO54693 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdaO54693 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EdaO54693 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EdaO54693 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EdaO54693 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EdaO54693 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EdaO54693 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EdaO54693 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EdaO54693 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EdaO54693 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EdaO54693 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdaO54693 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdaO54693 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdaO54693 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdaO54693 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdaO54693 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdaO54693 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdaO54693 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EdaO54693 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EdaO54693 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EdaO54693 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EdaO54693 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EdaO54693 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EdaO54693 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EdaO54693 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EdaO54693 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EdaO54693 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EdaO54693 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EdaO54693 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EdaO54693 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EdaO54693 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EdaO54693 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EdaO54693 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EdaO54693 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EdaO54693 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EdaO54693 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EdaO54693 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EdaO54693 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EdaO54693 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EdaO54693 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EdaO54693 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EdaO54693 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EdaO54693 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EdaO54693 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EdaO54693 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EdaO54693 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EdaO54693 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EdaO54693 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EdaO54693 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EdaO54693 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EdaO54693 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EdaO54693 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EdaO54693 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EdaO54693 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EdaO54693 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EdaO54693 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EdaO54693 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EdaO54693 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EdaO54693 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EdaO54693 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EdaO54693 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EdaO54693 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EdaO54693 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EdaO54693 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EdaO54693 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EdaO54693 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EdaO54693 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EdaO54693 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EdaO54693 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EdaO54693 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EdaO54693 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EdaO54693 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EdaO54693 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EdaO54693 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EdaO54693 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EdaO54693 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EdaO54693 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EdaO54693 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EdaO54693 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EdaO54693 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EdaO54693 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EdaO54693 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EdaO54693 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms