Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Per1O35973 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Per1O35973 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Per1O35973 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Per1O35973 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Per1O35973 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Per1O35973 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Per1O35973 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Per1O35973 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Per1O35973 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Per1O35973 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Per1O35973 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Per1O35973 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Per1O35973 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Per1O35973 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Per1O35973 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Per1O35973 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Per1O35973 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Per1O35973 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per1O35973 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per1O35973 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per1O35973 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per1O35973 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Per1O35973 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Per1O35973 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Per1O35973 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Per1O35973 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Per1O35973 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Per1O35973 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Per1O35973 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Per1O35973 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Per1O35973 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Per1O35973 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Per1O35973 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Per1O35973 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Per1O35973 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Per1O35973 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Per1O35973 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Per1O35973 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Per1O35973 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Per1O35973 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Per1O35973 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Per1O35973 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Per1O35973 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Per1O35973 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Per1O35973 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Per1O35973 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Per1O35973 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Per1O35973 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Per1O35973 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Per1O35973 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Per1O35973 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Per1O35973 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Per1O35973 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Per1O35973 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Per1O35973 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Per1O35973 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Per1O35973 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Per1O35973 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Per1O35973 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Per1O35973 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Per1O35973 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Per1O35973 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Per1O35973 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Per1O35973 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Per1O35973 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Per1O35973 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Per1O35973 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Per1O35973 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Per1O35973 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Per1O35973 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Per1O35973 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Per1O35973 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Per1O35973 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Per1O35973 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Per1O35973 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Per1O35973 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Per1O35973 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Per1O35973 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Per1O35973 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Per1O35973 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Per1O35973 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Per1O35973 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Per1O35973 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Per1O35973 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Per1O35973 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Per1O35973 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Per1O35973 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms