Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FxnO35943 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FxnO35943 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FxnO35943 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FxnO35943 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FxnO35943 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FxnO35943 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FxnO35943 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FxnO35943 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FxnO35943 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FxnO35943 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FxnO35943 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FxnO35943 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FxnO35943 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FxnO35943 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FxnO35943 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FxnO35943 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FxnO35943 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FxnO35943 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FxnO35943 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FxnO35943 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FxnO35943 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FxnO35943 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FxnO35943 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FxnO35943 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FxnO35943 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FxnO35943 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FxnO35943 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FxnO35943 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FxnO35943 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FxnO35943 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FxnO35943 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FxnO35943 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FxnO35943 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FxnO35943 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FxnO35943 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FxnO35943 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FxnO35943 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FxnO35943 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FxnO35943 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FxnO35943 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FxnO35943 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FxnO35943 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FxnO35943 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FxnO35943 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FxnO35943 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FxnO35943 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FxnO35943 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FxnO35943 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FxnO35943 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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FxnO35943 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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FxnO35943 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FxnO35943 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FxnO35943 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FxnO35943 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FxnO35943 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FxnO35943 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FxnO35943 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FxnO35943 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FxnO35943 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FxnO35943 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FxnO35943 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FxnO35943 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FxnO35943 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FxnO35943 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FxnO35943 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FxnO35943 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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