Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppfibp2O35711 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppfibp2O35711 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfibp2O35711 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppfibp2O35711 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms