Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clk2O35491 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk2O35491 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk2O35491 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk2O35491 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clk2O35491 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clk2O35491 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clk2O35491 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clk2O35491 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clk2O35491 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clk2O35491 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk2O35491 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk2O35491 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk2O35491 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clk2O35491 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clk2O35491 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clk2O35491 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk2O35491 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clk2O35491 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clk2O35491 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clk2O35491 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms