Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc27a2O35488 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc27a2O35488 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc27a2O35488 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc27a2O35488 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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