Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kpna4O35343 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kpna4O35343 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kpna4O35343 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms