Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srsf5O35326 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Srsf5O35326 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srsf5O35326 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf5O35326 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms