Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn9O35239 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptpn9O35239 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn9O35239 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms