Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casq1O09165 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casq1O09165 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casq1O09165 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casq1O09165 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Casq1O09165 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casq1O09165 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casq1O09165 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casq1O09165 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casq1O09165 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casq1O09165 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casq1O09165 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Casq1O09165 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Casq1O09165 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Casq1O09165 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Casq1O09165 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Casq1O09165 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
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