Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ltbp2O08999 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ltbp2O08999 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp2O08999 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp2O08999 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms