Protein–RNA interactions for Protein: O08811

Ercc2, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc2O08811 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ercc2O08811 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc2O08811 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc2O08811 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc2O08811 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms