Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Barx2O08686 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Barx2O08686 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Barx2O08686 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Barx2O08686 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Barx2O08686 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Barx2O08686 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Barx2O08686 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Barx2O08686 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Barx2O08686 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Barx2O08686 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Barx2O08686 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms