Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacna2d1O08532 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacna2d1O08532 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna2d1O08532 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d1O08532 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms