Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc191J3QQ27 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc191J3QQ27 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc191J3QQ27 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms