Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21972J3QN38 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21972J3QN38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21972J3QN38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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