Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21818J3KMS6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21818J3KMS6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21818J3KMS6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms