Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z7

Vmn2r75, MCG3425, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r75G5E8Z7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r75G5E8Z7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r75G5E8Z7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r75G5E8Z7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vmn2r75G5E8Z7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r75G5E8Z7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r75G5E8Z7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r75G5E8Z7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r75G5E8Z7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r75G5E8Z7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r75G5E8Z7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r75G5E8Z7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r75G5E8Z7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r75G5E8Z7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms