Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfip1G5E8V9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arfip1G5E8V9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfip1G5E8V9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfip1G5E8V9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms