Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sclt1G5E861 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sclt1G5E861 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sclt1G5E861 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sclt1G5E861 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sclt1G5E861 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms