Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22,22■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22,22■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,15
Trim55G3X8Y1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22,16■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
Trim55G3X8Y1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22,11■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
Trim55G3X8Y1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,8 ms