Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ScaperF8VQ70 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ScaperF8VQ70 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ScaperF8VQ70 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ScaperF8VQ70 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ScaperF8VQ70 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.3 ms