Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Colca2F8VPY8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Colca2F8VPY8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Colca2F8VPY8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms