Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Farp1F8VPU2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Farp1F8VPU2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Farp1F8VPU2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Farp1F8VPU2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms