Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5160F8VPN3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5160F8VPN3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5160F8VPN3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms