Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm8334F7CD45 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8334F7CD45 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8334F7CD45 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8334F7CD45 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms