Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm17093F6XGJ4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17093F6XGJ4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm17093F6XGJ4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms