Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28305F6U473 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm28305F6U473 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28305F6U473 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.3 ms