Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga10E9Q6R1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga10E9Q6R1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itga10E9Q6R1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms