Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
BC005561E9Q5E2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BC005561E9Q5E2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BC005561E9Q5E2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
BC005561E9Q5E2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BC005561E9Q5E2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms