Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2010300C02RikE9Q3M9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
2010300C02RikE9Q3M9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
2010300C02RikE9Q3M9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
2010300C02RikE9Q3M9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms