Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pdzd2E9Q1M1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pdzd2E9Q1M1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pdzd2E9Q1M1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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