Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clca3bE9PUL3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clca3bE9PUL3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clca3bE9PUL3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms