Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Piezo1E2JF22 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Piezo1E2JF22 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Piezo1E2JF22 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Piezo1E2JF22 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Piezo1E2JF22 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms