Protein–RNA interactions for Protein: E0CX23

Umad1, MCG2776, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Umad1E0CX23 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Umad1E0CX23 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Umad1E0CX23 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Umad1E0CX23 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Umad1E0CX23 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Umad1E0CX23 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Umad1E0CX23 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Umad1E0CX23 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Umad1E0CX23 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms