Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930467E23RikD3Z1P8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930467E23RikD3Z1P8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms