Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cttnbp2B9EJA2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cttnbp2B9EJA2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cttnbp2B9EJA2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Cttnbp2B9EJA2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cttnbp2B9EJA2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Cttnbp2B9EJA2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cttnbp2B9EJA2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms