Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pnldc1B2RXZ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pnldc1B2RXZ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms