Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol7aB2RT54 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol7aB2RT54 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apol7aB2RT54 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms