Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H60cB1B213 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H60cB1B213 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H60cB1B213 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H60cB1B213 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H60cB1B213 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H60cB1B213 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H60cB1B213 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H60cB1B213 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H60cB1B213 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H60cB1B213 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H60cB1B213 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H60cB1B213 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms