Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Palm3A2TJV2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Palm3A2TJV2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Palm3A2TJV2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Palm3A2TJV2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Palm3A2TJV2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Palm3A2TJV2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Palm3A2TJV2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms